一、申请

1、准备资料：根据变更事项的不同，准备相应的申请材料。这些材料可能包括保健食品变更申请表、注册证书及其附件复印件、变更的具体事项及理由、证明文件（国家管理部门出具的变更证明）、产品配方、生产工艺、标签说明书样稿等。

2、提交申请：将准备好的申请材料提交给国家国家市场监督管理总局指定的受理机构。

二、受理

1、形式审查：受理机构对提交的申请材料进行形式审查，检查材料是否齐全、符合法定形式，以及申请事项是否属于行政主体的职权范围等。

2、决定是否受理：如果申请材料齐全、符合法定形式，且属于行政主体的职权范围，则受理机构会出具资料签收单及流程单。如果申请材料存在问题，受理机构会一次性告知申请人需要补正的材料。

三、审查

1、形式审查：对申报资料进行形式审查，确保资料完整、准确。

2、现场检查（如需）：对于某些变更事项，如改变产品规格、食用量、保质期和质量标准等，可能需要进行现场核查，以了解企业的生产条件和产品质量控制情况。

3、样品检验（如需）：对于涉及产品规格、质量标准变更的申请，还需要对检验样品进行送检，以确保变更后的产品仍符合相关法规和标准要求。

四、审核与审定

1、审核：对审查意见进行审核，签署同意或不同意上报的意见。如果不同意上报，应书面说明理由。

2、审定：对审核意见进行审定，符合相关规定的，签署同意上报的意见；不符合相关规定的，签署不同意上报的意见，并说明理由。

五、制作文书与邮寄资料

按照审定意见制作文书，交局政务中心。然后按要求将资料及文书打包，邮寄给国家市场监督管理总局或指定的审评机构。

六、公告与送达

1、公告：在相关网站上公示审批结果，以便公众查询。

2、送达：告知申请人办理结果，并送达相关文书。如果准予变更，会颁发新的保健食品注册证书或变更批件；如果不准予变更，应书面说明理由。

此外，以上流程仅供参考，具体流程可能因地区和具体变更事项的不同而有所差异。在实际操作中，申请人应根据当地市场监督管理部门的要求和指引进行申请。